Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms