Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms