Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ciao1Q99KN2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ciao1Q99KN2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ciao1Q99KN2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ciao1Q99KN2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms