Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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