Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TnrQ8BYI9 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TnrQ8BYI9 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms