Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Snx17Q8BVL3 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Snx17Q8BVL3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Snx17Q8BVL3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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