Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms