Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms