Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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