Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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