Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Sox17Q61473 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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