Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PcolceQ61398 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms