Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
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