Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34b4Q3V0X2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms