Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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BB287469Q3UT53 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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BB287469Q3UT53 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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BB287469Q3UT53 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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BB287469Q3UT53 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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BB287469Q3UT53 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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BB287469Q3UT53 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BB287469Q3UT53 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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