Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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