Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trappc10Q3TLI0 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trappc10Q3TLI0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trappc10Q3TLI0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trappc10Q3TLI0 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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