Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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