Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ttc39dQ0VF76 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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