Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms