Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms