Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms