Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aplp2Q06335 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms