Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm8513-201ENSMUST00000182830 1003 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm44792-201ENSMUST00000207008 1628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm12479-201ENSMUST00000120731 1585 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm17219-201ENSMUST00000168439 593 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Mocs2-210ENSMUST00000183407 1074 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms