Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms