Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms