Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Zfp169-201ENSMUST00000110110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Lpar1-202ENSMUST00000107570 3244 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Kcnk2-201ENSMUST00000079451 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Meis2-201ENSMUST00000028639 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Bag6-211ENSMUST00000173550 3536 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Pde4b-201ENSMUST00000030251 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms