Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms