Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gbx1P82976 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gbx1P82976 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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