Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms