Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CgnP59242 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CgnP59242 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CgnP59242 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms