Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CartptP56388 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms