Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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SftpbP50405 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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SftpbP50405 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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SftpbP50405 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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SftpbP50405 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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SftpbP50405 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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