Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms