Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms