Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms