Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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