Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms