Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atxn10P28658 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atxn10P28658 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atxn10P28658 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atxn10P28658 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atxn10P28658 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atxn10P28658 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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