Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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