Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pde6aP27664 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pde6aP27664 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pde6aP27664 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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