Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms