Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18524 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms