Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DmdP11531 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DmdP11531 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DmdP11531 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DmdP11531 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms