Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Csf1P07141 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csf1P07141 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms