Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms