Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms