Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2-Ab1P01921 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms