Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Q1O19441 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Q1O19441 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Q1O19441 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Q1O19441 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Q1O19441 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Q1O19441 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Q1O19441 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Q1O19441 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Q1O19441 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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