Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms